Kok-Willemsen trad in 2006 in dienst als manager vrouwenvoetbal. Van 2007 tot 2011 was ze hoofdtrainer van FC Twente Vrouwen. In 2011 werd ze hoof vrouwenvoetbal. In beide functies wist ze met het eerste vrouwenelftal diverse malen het Nederlands kampioenschap en de titel in de BeNe League te winnen. Hoewel FC Twente er op de eigen site met geen woord over rept, lijkt het vertrek verband te houden met de financiële problemen bij de club en de wens om het vrouwenvoetbal in een aparte stichting onder te brengen. Met het vertrek van Kok-Willemsen komt er ook een einde aan de voetbalschool FC Twente University. Op 6 mei is de laatste clinic en op 17 mei is de laatste voetbalschool. Tot die tijd wordt het reguliere programma gedraaid, zo meldt FC Twente op de eigen website.